Binnen Civil Infra Benelux zijn een aantal werkgroepen actief. Deze werkgroepen specialiseren zich elk in een bepaald softwarepakket. Momenteel zijn er 3 werkgroepen actief, namelijk Werkgroep Civil 3D, Werkgroep Revit en Werkgroep Infraworks. Iedere werkgroep heeft zijn eigen specifieke taken, en is opgebouwd uit een aantal themagroepen:
